Distribution and frequency of tomato ringspot virus (ToRSV) in different varieties of Rubus idaeus in the Maule Region, Chile

Distribución y frecuencia de tomato ringspot virus (ToRSV) en diferentes variedades de Rubus idaeus en la Región del Maule, Chile

Gloria Rossana González Silva, Cynthia Macarena Concha Espinoza, Myriam Andrea Valenzuela Bustamante, Luzmira Cecilia Cordero Alday, José Newthon Pico Mendoza, Pablo Alfredo Cáceres Ruz, Rolando García González

Pág. 143

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Abstract

The raspberry (Rubus idaeus) is one of the most important fruit for production in the Maule Region, Chile. Raspberries are affected by the tomato ringspot virus (ToRSV), which causes decreased yield and deformed fruit. The objective of this work is to study ToRSV spread in different raspberry varieties in the Maule Region, Chile. The virus was detected using the ELISA test and RT-PCR in the Heritage, Meeker, Chilliwack, Amity and Coho varieties. Bayesian analysis determined the relationship between the percentage of ToRSV incidence in the cultivated varieties and the locations in the different provinces of the Maule Region. It was observed that the Linares province showed the highest levels of the virus in the different varieties: Amity (70%), Meeker (39%) and Heritage (26%), compared to other provinces in the region. These results suggest a high spread of ToRSV through the Maule Region. Nei distance analysis suggests that 14 of the virus isolates coming from the Talca and Linares Provinces would show differences with the ToRSV accessions deposited in the global gene bank (NCBI).

Keywords: ToRSV • Rubus idaeus • disease • spread • incidence • Maule • Chile

 


Resumen

La frambuesa (Rubus idaeus) es un frutal menor de gran importancia productiva en Chile. Una de las enfermedades que lo afectan es tomato ringspot virus (ToRSV). Este estudio provee información sobre la dispersión de ToRSV en diferentes variedades de frambueso en la Región del Maule. El virus fue detectado mediante el uso de la prueba ELISA y RT-PCR en las variedades Heritage, Meeker, Chilliwack, Amity y Coho. Mediante un análisis Bayesiano se determinó la relación entre porcentaje de incidencia de ToRSV en las variedades cultivadas y las localidades, de las distintas Provincias de la Región. Se observó que la provincia de Linares presentó la más alta incidencia viral en Amity (70%), Meeker (39%) y Heritage (26%), con respecto a otras provincias de la Región. Estos resultados sugieren que existe una alta dispersión de ToRSV a través de la Región del Maule. El análisis de distancia de Nei propone que los 14 aislados del virus provenientes desde las Provincias de Talca y Linares, mostrarían diferencias con las accesiones de ToRSV depositadas en el banco de genes mundial (NCBI).

Palabras claves: ToRSV • Rubus idaeus • dispersión • incidencia • Maule • Chile

 
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